Zelda is geen spook in Spirit Tracks omdat Nintendo dit altijd zo gewild heeft, maar door een gebrek aan zin van de ontwikkelaars.
Tijdens het spelen van The Legend of Zelda: Spirit Tracks kom je te weten waarom Princess Zelda een spook is, maar volgens Eiji Aonuma is er nog een andere reden waarom Nintendo deze keuze heeft gemaakt: het team wilde haar namelijk een speelbaar personage maken, maar dan hadden ze haar jurk moeten animeren, iets waar veel tijd in zou kruipen.
En daarom hebben de schrijvers een reden verzonnen waarom Zelda een spook is: haar lichaam is gestolen en haar ziel gaat de Phantom Guardians binnen. Zo zie je maar dat niet alle beslissingen er komen door geniale hersenkronkels van de mannen van Nintendo!