Deze opvolger vervolgt het verhaal van Alma, een jong meisje met bovennatuurlijke krachten. Haar woede tegen iedereen die haar iets misdaan heeft, leidt er toe dat zij de bestaande realiteit vernietigt
en vervangt door haar eigen.
Als Michael Becket, is het aan jou om dit stoppen. Michael is een Delta Force soldaat, welke ongeveer dertig minuten voor einde van F.E.A.R. word ingezet om Genevieve Aristide te arresteren.
Lead Designer John Mulkey heeft in een interview al aangeven dat de game een meer "open environment" heeft en dat "de vernietigde stad een hoop nieuwe mogelijkheden biedt". Tevens laat John Mulkey weten dat de vijanden veel meer gevarieerd zijn.




